Die Anfänge der Pfarrei St. Nikolaus reichen bis ins 1. Jahrtausend zurück. Mönche von St. Gallen gründeten um 800 am Fuß des Zellerhorns
eine Niederlassung. Diese Siedlung mit dem Namen „Zell“ wird urkundlich mit Kirche und Pfarrer erstmals im Jahr 1255 erwähnt. Die
Wallfahrtskirche Maria Zell erinnert bis heute an diese Vergangenheit.

Das Jahr 1488 markiert eine Wende in der Geschichte von Boll, als der damalige Pfarrer von Zell seinen Wohnsitz „neben die St. Nikolauskirche zu Boll“ verlegte. Von da an verlagerte sich auch das Leben der Pfarrgemeinde immer mehr ins Tal, so dass 1864 die Kirche in Boll zur Pfarrkirche erklärt wurde, obwohl sie damals in einem sehr schlechten Zustand war. Außerdem fand nur noch die Hälfte der Bevölkerung in dem Kirchlein Platz, so dass die Einwohner von Boll auf den Bau einer neuen Pfarrkirche hofften. Pfarrer Söll war es, der im Jahre 1903 den Bauplatz für die Kirche und das Pfarrhaus erwarb, 1904 wurde Pfarrer Saurer durch Kirchen und Gemeinderat der Auftrag erteilt, mit dem Architekten Laur einen Bauplan für Kirche und Pfarrhaus auszuarbeiten. Im Herbst 1904 kam Pfarrer Häussler nach Boll. Als tatkräftiger und baufreudiger Priester sammelte er eifrig Geld und trieb den Kirchenbau voran. So konnte mit dem Neubau im damals hochmodernen Jugendstil bereits 1908 begonnen werden. Ein Jahr später war es dann soweit: Der Freiburger Erzbischof Thomas Nörber konnte das neue Gotteshaus unter großer Beteiligung der Bevölkerung einweihen.